A Magyar Vállalkozásfejlesztési Alapítványt 1990-ben abból a célból hozták létre, hogy önálló programmegvalósító intézményként végrehajtsa a kormány gazdaságfejlesztési stratégiáját, kis- és középvállalkozások fejlesztését célzó munkaprogramját.
  A Phare kis- és középvállalkozás fejlesztési programok koordinálására az MVA-t 1992-ben jelölték ki. Az elmúlt több mint egy évtizedben az MVA kizárólagos szerepe azonban megszűnt a vállalkozásfejlesztést szolgáló Phare programokban jelenleg ezt a funkciót más intézménnyel közösen gyakorolva, illetve megosztva egyre korlátozottabb feladatkörrel tölti be.
  Az MVA 2002-ben is az alapító okiratban megfogalmazott közhasznú célok megvalósítása érdekében munkálkodott. Így részt vállalt a kormány által kezdeményezett gazdaságfejlesztési programok tervezésében, megszervezésében és végrehajtásában, végezte a hazai és nemzetközi vállalkozásfejlesztéshez kapcsolódó forrásoly gyűjtését és közvetítését az alapítványhoz hasonló célt megvalósító programokra, illetve szervezetekhez, előmozdította a kkv-k euroatlanti integrációját és támogatta a mikro- és kisvállalkozások fejlődését segítő oktatási, információszolgáltatási, illetve tanácsadási tevékenységet.

  A mellékelt táblázatból látható, hogy az MVA az előcsatlakozás évei alatt nagy gyakorlatra tett szert európai uniós programok bonyolításában és számos Phare-program végrehajtásában vett részt.
  Az MVA közel 20 milliárd forint európai uniós támogatás eljuttatását koordinálta több tízezer kedvezményezett részére.
  A támogatásokból egyaránt részesültek mind a vállalkozásfejlesztési szervezetek, mind a vállalkozások. A kezdeti éveltben a fő cél a vállalkozásfejlesztési intézményrendszer kiépítése és a magyar kisvállalkozói szektorban induló új vállalkozások segítése volt, mind szakmai tanácsadással, mind pénzügyi programok megvalósításával. A későbbiekben a hangsúly a már meglévő vállalkozások erősítésére és fejlesztésére helyeződött át.

Az MVA koordinációjával megvalósuló legutolsó HU9906-01-es számú Phare program keretében megközelítően több, mint 3,5 milliárd forint került kifizetésre európai uniós és hazai forrásból együttesen. A támogatásnak köszönhetően közel 40 ezer vállalkozó vette igénybe a helyi vállalkozói központok által biztosított információs, tanácsadási és képzési szolgáltatást. Közel 4000 vállalkozás igényelt kedvezményes mikrohitelt, 130 vállalkozó részesült vissza nem térítendő támogatásban marketing és termékfejlesztési célok megvalósítására. 20 darab működő inkubátorház kapott vissza nem térítendő támogatást szolgáltatásai bővítésére, valamint új szolgáltatások létrehozására, amivel kb. 800 vállalkozás lehetőségei javulnak. Egy új inkubátorház építése kezdődött meg, biztosítva 40 vállalkozás működési feltételét. 27 emelt szintű vállalkozásfejlesztési program valósult meg vissza nem térítendő támogatásból, amelynek 15 ezer vállalkozás a közvetett kedvezményezettje.

  A Magyar Vállalkozásfejlesztési Alapítvány mind a mai napig az alapító okiratában megfogalmazott céljainak megfelelően végzi tevékenységét:
„Az Alapítvány célja, hogy elősegítse a mikro-, kis- és közepes méretű magánvállalkozások szakmai, vállalkozói, piaci fejlődését, tőkeerejük növelését, a vállalkozói kultúra fejlődését, valamint új vállalkozások létrejöttét. Az alapítvány szabályozott pénzügyi keretet teremt a rendelkezésére álló bel- és külföldi források kezelése céljára ”.
2001-2002-ben „ Az európai uniós csatlakozás hatása a kis- és közepes vállalkozásokra - Útmutató kisvállalkozások és tanácsadók számára” című kiadvánnyal is segítette az MVA a kisvállalkozások felkészítését az uniós csatlakozásra. A kiadványt a helyi vállalkozásfejlesztési központokban díjtalanul kapták meg a vállalkozók.
Az MVA számos partnerrel működik együtt. Ezek közül kiemelkedik a GKM(GM), a Nemzeti Fejlesztési Terv és EU Támogatások Hivatala (Phare-ügyekért felelős tárca nélküli miniszter hivatala), az FVM VATI Kht, a GyISM (ISM), a MAK Rt., a Postabank Rt. Rendszeres információs kapcsolat alakult ki a kisvállalkozói érdekképviseletekkel, akikkel hosszú távú együttműködés előkészítésére is sor került.